Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 YPL067CYPL067C 597 nt9.68□□□□□ -0.86
UBP1P25037 MPH3YJR160C 1809 nt9.68□□□□□ -0.86
UBP1P25037 YMR209CYMR209C 1374 nt9.67□□□□□ -0.86
UBP1P25037 APT1YML022W 564 nt9.67□□□□□ -0.86
UBP1P25037 ARO8YGL202W 1503 nt9.66□□□□□ -0.86
UBP1P25037 YER152CYER152C 1332 nt9.66□□□□□ -0.86
UBP1P25037 TRR2YHR106W 1029 nt9.66□□□□□ -0.86
UBP1P25037 MSI1YBR195C 1269 nt9.66□□□□□ -0.86
UBP1P25037 YJL107CYJL107C 1164 nt9.65□□□□□ -0.86
UBP1P25037 KES1YPL145C 1305 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP1P25037 TIF3YPR163C 1311 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP1P25037 SWP1YMR149W 861 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP1P25037 CYS4YGR155W 1524 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP1P25037 MEP1YGR121C 1479 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP1P25037 BIO3YNR058W 1443 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP1P25037 KDX1YKL161C 1302 nt9.63□□□□□ -0.87
UBP1P25037 AIM20YIL158W 615 nt9.63□□□□□ -0.87
UBP1P25037 SHC1YER096W 1539 nt9.62□□□□□ -0.87
UBP1P25037 MBF1YOR298C-A 456 nt9.62□□□□□ -0.87
UBP1P25037 GGA2YHR108W 1758 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP1P25037 snR78snR78 87 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP1P25037 BUB2YMR055C 921 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP1P25037 AST1YBL069W 1290 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP1P25037 LSR1LSR1 1175 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP1P25037 YGL081WYGL081W 963 nt9.59□□□□□ -0.87
UBP1P25037 RSM23YGL129C 1353 nt9.59□□□□□ -0.87
UBP1P25037 STS1YIR011C 960 nt9.58□□□□□ -0.88
UBP1P25037 SGA1YIL099W 1650 nt9.58□□□□□ -0.88
UBP1P25037 UGP1YKL035W 1500 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 NMA2YGR010W 1188 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 YJR142WYJR142W 1029 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 IMD1YAR073W 1212 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 LDB7YBL006C 543 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 YNL165WYNL165W 1221 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP1P25037 YDR387CYDR387C 1668 nt9.56□□□□□ -0.88
UBP1P25037 KRR1YCL059C 951 nt9.56□□□□□ -0.88
UBP1P25037 ARO3YDR035W 1113 nt9.56□□□□□ -0.88
UBP1P25037 ADH6YMR318C 1083 nt9.56□□□□□ -0.88
UBP1P25037 RPD3YNL330C 1302 nt9.56□□□□□ -0.88
UBP1P25037 YNR068CYNR068C 819 nt9.55□□□□□ -0.88
UBP1P25037 ERG10YPL028W 1197 nt9.55□□□□□ -0.88
UBP1P25037 ERV2YPR037C 591 nt9.54□□□□□ -0.88
UBP1P25037 FCY22YER060W-A 1593 nt9.54□□□□□ -0.88
UBP1P25037 HOS2YGL194C 1359 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP1P25037 TMS1YDR105C 1422 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP1P25037 GID8YMR135C 1368 nt9.52□□□□□ -0.88
UBP1P25037 CDC3YLR314C 1563 nt9.51□□□□□ -0.89
UBP1P25037 FYV1YDR024W 486 nt9.51□□□□□ -0.89
UBP1P25037 SML1YML058W 315 nt9.51□□□□□ -0.89
UBP1P25037 MAS1YLR163C 1389 nt9.5□□□□□ -0.89
UBP1P25037 PSD1YNL169C 1503 nt9.49□□□□□ -0.89
UBP1P25037 APM1YPL259C 1428 nt9.48□□□□□ -0.89
UBP1P25037 SCS22YBL091C-A 528 nt9.48□□□□□ -0.89
UBP1P25037 YHL008CYHL008C 1884 nt9.48□□□□□ -0.89
UBP1P25037 COX16YJL003W 357 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 TES1YJR019C 1050 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 YKL147CYKL147C 618 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 URE2YNL229C 1065 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 ARG7YMR062C 1326 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 YKL133CYKL133C 1392 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 EEB1YPL095C 1371 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 THI3YDL080C 1830 nt9.47□□□□□ -0.89
UBP1P25037 FRA1YLL029W 2250 nt9.46□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YCR099CYCR099C 468 nt9.46□□□□□ -0.9
UBP1P25037 RMA1YKL132C 1293 nt9.46□□□□□ -0.9
UBP1P25037 CYT1YOR065W 930 nt9.46□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YJL211CYJL211C 444 nt9.45□□□□□ -0.9
UBP1P25037 PIC2YER053C 903 nt9.44□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YBL081WYBL081W 1107 nt9.44□□□□□ -0.9
UBP1P25037 AAC3YBR085W 924 nt9.44□□□□□ -0.9
UBP1P25037 DCR2YLR361C 1737 nt9.44□□□□□ -0.9
UBP1P25037 HXT8YJL214W 1710 nt9.43□□□□□ -0.9
UBP1P25037 MDH1YKL085W 1005 nt9.43□□□□□ -0.9
UBP1P25037 SCO2YBR024W 906 nt9.43□□□□□ -0.9
UBP1P25037 HRB1YNL004W 1365 nt9.42□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YKL153WYKL153W 510 nt9.42□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YMR147WYMR147W 672 nt9.42□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YHR218WYHR218W 1812 nt9.41□□□□□ -0.9
UBP1P25037 IRC7YFR055W 1023 nt9.41□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YJL009WYJL009W 327 nt9.41□□□□□ -0.9
UBP1P25037 MRS6YOR370C 1812 nt9.4□□□□□ -0.9
UBP1P25037 AGP3YFL055W 1677 nt9.4□□□□□ -0.9
UBP1P25037 YGL118CYGL118C 438 nt9.4□□□□□ -0.9
UBP1P25037 RPC31YNL151C 756 nt9.4□□□□□ -0.9
UBP1P25037 DMA2YNL116W 1569 nt9.39□□□□□ -0.91
UBP1P25037 GLY1YEL046C 1164 nt9.39□□□□□ -0.91
UBP1P25037 GPD1YDL022W 1176 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 LIA1YJR070C 978 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 GPM1YKL152C 744 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 MOD5YOR274W 1287 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 ZAP1YJL056C 2643 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 MCM5YLR274W 2328 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 DML1YMR211W 1428 nt9.38□□□□□ -0.91
UBP1P25037 GPD2YOL059W 1323 nt9.37□□□□□ -0.91
UBP1P25037 ICE2YIL090W 1476 nt9.37□□□□□ -0.91
UBP1P25037 YEL074WYEL074W 339 nt9.37□□□□□ -0.91
UBP1P25037 YRF1-3YGR296W 5580 nt9.37□□□□□ -0.91
UBP1P25037 YRF1-6YNL339C 5580 nt9.37□□□□□ -0.91
UBP1P25037 YRF1-7YPL283C 5580 nt9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18 ms