Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms