Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC24CP53992 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.2 ms