Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFLP07196 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFLP07196 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFLP07196 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFLP07196 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFLP07196 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFLP07196 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFLP07196 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms