Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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