Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRTO14522 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
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PTPRTO14522 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRTO14522 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
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