Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN13Q12923 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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