Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms