Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms