Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHMG1C9JSJ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms