Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRTO14522 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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