Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms