Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms