Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms