Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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