Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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EXT1Q16394 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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EXT1Q16394 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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EXT1Q16394 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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EXT1Q16394 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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EXT1Q16394 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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EXT1Q16394 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT1Q16394 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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