Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms