Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms