Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms