Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3TC1Q8TE82 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC1Q8TE82 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms