Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms