Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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