RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 NischQ80TM9 1593 aa30.98■■■□□ 2.55
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Trim11-201ENSMUST00000093061 Abcc8B2RUS7 1588 aa29.49■■■□□ 2.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.31■■■□□ 2.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rtl1Q7M732 1744 aa27.93■■■□□ 2.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 ScribQ80U72 1612 aa27.68■■■□□ 2.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dcaf1Q80TR8 1506 aa27.47■■□□□ 1.99
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc180J3QNE4 1664 aa27.26■■□□□ 1.96
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa27.18■■□□□ 1.94
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kdm5dQ62240 1548 aa27.09■■□□□ 1.93
Trim11-201ENSMUST00000093061 NacadQ5SWP3 1504 aa26.88■■□□□ 1.89
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Trim11-201ENSMUST00000093061 Baz1aO88379 1555 aa26.83■■□□□ 1.89
Trim11-201ENSMUST00000093061 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.36■■□□□ 1.81
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.3■■□□□ 1.8
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa26.26■■□□□ 1.79
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.2■■□□□ 1.78
Trim11-201ENSMUST00000093061 HrcG5E8J6 738 aa25.96■■□□□ 1.75
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.81■■□□□ 1.72
Trim11-201ENSMUST00000093061 BicraF8VPZ9 1578 aa25.76■■□□□ 1.71
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trim41Q5NCC3 630 aa25.76■■□□□ 1.71
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa25.55■■□□□ 1.68
Trim11-201ENSMUST00000093061 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Trim11-201ENSMUST00000093061 Synj1Q8CHC4 1574 aa25.37■■□□□ 1.65
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cep164Q5DU05 1446 aa25.27■■□□□ 1.64
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.2■■□□□ 1.62
Trim11-201ENSMUST00000093061 CftrP26361 1476 aa25.19■■□□□ 1.62
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa25.17■■□□□ 1.62
Trim11-201ENSMUST00000093061 Golga3P55937 1487 aa25.15■■□□□ 1.62
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Trim11-201ENSMUST00000093061 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Trim11-201ENSMUST00000093061 Top2bQ64511 1612 aa24.98■■□□□ 1.59
Trim11-201ENSMUST00000093061 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Trim11-201ENSMUST00000093061 Chic1Q8CBW7 227 aa24.94■■□□□ 1.58
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.93■■□□□ 1.58
Trim11-201ENSMUST00000093061 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.84■■□□□ 1.57
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.79■■□□□ 1.56
Trim11-201ENSMUST00000093061 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gab3Q8BSM5 595 aa24.7■■□□□ 1.55
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fmn1Q05860 1466 aa24.57■■□□□ 1.52
Trim11-201ENSMUST00000093061 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wdr62Q3U3T8 1523 aa24.37■■□□□ 1.49
Trim11-201ENSMUST00000093061 Frmpd1A2AKB4 1549 aa24.33■■□□□ 1.49
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pcgf6Q99NA9 353 aa24.32■■□□□ 1.48
Trim11-201ENSMUST00000093061 TnnQ80Z71 1560 aa24.29■■□□□ 1.48
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa24.28■■□□□ 1.48
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.26■■□□□ 1.47
Trim11-201ENSMUST00000093061 Unc13aQ4KUS2 1712 aa24.21■■□□□ 1.47
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lamc3Q9R0B6 1581 aa24.11■■□□□ 1.45
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cep162Q6ZQ06 1403 aa24.06■■□□□ 1.44
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.98■■□□□ 1.43
Trim11-201ENSMUST00000093061 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Trim11-201ENSMUST00000093061 Npm2Q80W85 207 aa23.97■■□□□ 1.43
Trim11-201ENSMUST00000093061 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
Trim11-201ENSMUST00000093061 Camsap1A2AHC3 1581 aa23.91■■□□□ 1.42
Trim11-201ENSMUST00000093061 Myt1lP97500 1187 aa23.9■■□□□ 1.42
Trim11-201ENSMUST00000093061 Il27Q8K3I6 234 aa23.8■■□□□ 1.4
Trim11-201ENSMUST00000093061 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
Trim11-201ENSMUST00000093061 PtprkP35822 1457 aa23.79■■□□□ 1.4
Trim11-201ENSMUST00000093061 NrkQ9R0G8 1455 aa23.78■■□□□ 1.4
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.77■■□□□ 1.4
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
Trim11-201ENSMUST00000093061 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Trim11-201ENSMUST00000093061 Shroom4Q1W617 1475 aa23.74■■□□□ 1.39
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mier1Q5UAK0 511 aa23.73■■□□□ 1.39
Trim11-201ENSMUST00000093061 NefmP08553 848 aa23.71■■□□□ 1.39
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam135aQ6NS59 1506 aa23.69■■□□□ 1.38
Trim11-201ENSMUST00000093061 Grin2bQ01097 1482 aa23.68■■□□□ 1.38
Trim11-201ENSMUST00000093061 Clip1Q922J3 1391 aa23.64■■□□□ 1.37
Trim11-201ENSMUST00000093061 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cux2P70298 1426 aa23.62■■□□□ 1.37
Trim11-201ENSMUST00000093061 Map3k1P53349 1493 aa23.61■■□□□ 1.37
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.59■■□□□ 1.37
Trim11-201ENSMUST00000093061 Eea1Q8BL66 1411 aa23.49■■□□□ 1.35
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa23.49■■□□□ 1.35
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zeb1Q64318 1117 aa23.47■■□□□ 1.35
Trim11-201ENSMUST00000093061 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.47■■□□□ 1.35
Trim11-201ENSMUST00000093061 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Trim11-201ENSMUST00000093061 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa23.45■■□□□ 1.34
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arap1Q4LDD4 1452 aa23.45■■□□□ 1.34
Trim11-201ENSMUST00000093061 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Trim11-201ENSMUST00000093061 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa23.38■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.38■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Erich3F6QRE9 1637 aa23.38■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Efcab5A0JP43 1406 aa23.37■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Neurod1Q60867 357 aa23.36■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Duox2A2AQ99 1517 aa23.34■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ankrd26Q811D2 1581 aa23.33■■□□□ 1.33
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.29■■□□□ 1.32
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tiam1Q60610 1591 aa23.26■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Samd9lQ69Z37 1561 aa23.26■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa23.25■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Carmil1Q6EDY6 1374 aa23.22■■□□□ 1.31
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pcf11G3X9Z4 1553 aa23.22■■□□□ 1.31
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