Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms