Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms