Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NECAP2Q9NVZ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms