Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMB2P55268 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMB2P55268 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms