Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNIP3Q9Y2W7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNIP3Q9Y2W7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms