Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms