Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeastyeast

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN5Q02983 CMK2YOL016C 1344 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 NDE2YDL085W 1638 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 MET30YIL046W 1923 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 ADH7YCR105W 1086 nt7.61□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 MOB1YIL106W 945 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 CDD1YLR245C 429 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 ADH3YMR083W 1128 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 YNL140CYNL140C 570 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 BEM1YBR200W 1656 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 INO1YJL153C 1602 nt7.6□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 TIF3YPR163C 1311 nt7.59□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 PAU5YFL020C 369 nt7.59□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 IGD1YFR017C 588 nt7.59□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 YFR020WYFR020W 699 nt7.59□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 PHB2YGR231C 933 nt7.59□□□□□ -1.19
RRN5Q02983 PAU15YIR041W 375 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 YLR460CYLR460C 1131 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 CCR4YAL021C 2514 nt7.58□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 PFS2YNL317W 1398 nt7.57□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 MLS1YNL117W 1665 nt7.57□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 BUD31YCR063W 474 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 STP3YLR375W 1032 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 MDH2YOL126C 1134 nt7.56□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 INM1YHR046C 888 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 PGC1YPL206C 966 nt7.55□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 GLY1YEL046C 1164 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 TGL5YOR081C 2250 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 UBP13YBL067C 2244 nt7.54□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 HSV2YGR223C 1347 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 TDA4YJR116W 840 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 OLA1YBR025C 1185 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.53□□□□□ -1.2
RRN5Q02983 CHS7YHR142W 951 nt7.52□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 FRT1YOR324C 1809 nt7.52□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 MRN1YPL184C 1839 nt7.52□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 YNL190WYNL190W 615 nt7.51□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 SMC5YOL034W 3282 nt7.51□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 DAL7YIR031C 1665 nt7.51□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 EHT1YBR177C 1356 nt7.5□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 SLM3YDL033C 1254 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 YGR137WYGR137W 375 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 FLX1YIL134W 936 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 YLR280CYLR280C 351 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 YBR232CYBR232C 360 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 CRN1YLR429W 1956 nt7.49□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 LRO1YNR008W 1986 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 CYC3YAL039C 810 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 CKI1YLR133W 1749 nt7.48□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 HEL1YKR017C 1656 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 MRP7YNL005C 1116 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 MET22YOL064C 1074 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 BAP3YDR046C 1815 nt7.47□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 KTR4YBR199W 1395 nt7.46□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 DIP5YPL265W 1827 nt7.46□□□□□ -1.21
RRN5Q02983 BIM1YER016W 1035 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 SRP102YKL154W 735 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 RCF1YML030W 480 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 RNA170RNA170 169 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 IPL1YPL209C 1104 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 WSC3YOL105C 1671 nt7.46□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 PMT7YDR307W 1989 nt7.45□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 PMA2YPL036W 2844 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 CTF3YLR381W 2202 nt7.44□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.43□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 LAS17YOR181W 1902 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 PDC6YGR087C 1692 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 RHO1YPR165W 630 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 WSC4YHL028W 1818 nt7.42□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 ERO1YML130C 1692 nt7.41□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 ARO3YDR035W 1113 nt7.41□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 GGC1YDL198C 903 nt7.4□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 YPL264CYPL264C 1062 nt7.4□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 OCH1YGL038C 1443 nt7.4□□□□□ -1.22
RRN5Q02983 THI73YLR004C 1572 nt7.39□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 NAS6YGR232W 687 nt7.39□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 MET13YGL125W 1803 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 ALG7YBR243C 1347 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 YCR025CYCR025C 411 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 DPH5YLR172C 903 nt7.38□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 PUP3YER094C 618 nt7.37□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 CAK1YFL029C 1107 nt7.37□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 CIR2YOR356W 1896 nt7.36□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 YMR166CYMR166C 1107 nt7.36□□□□□ -1.23
RRN5Q02983 RSC9YML127W 1746 nt7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms