Protein–RNA interactions for Protein: P50623

UBC9, SUMO-conjugating enzyme UBC9, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBC9P50623 TMS1YDR105C 1422 nt7.59□□□□□ -1.19
UBC9P50623 YJL009WYJL009W 327 nt7.58□□□□□ -1.2
UBC9P50623 EMC3YKL207W 762 nt7.58□□□□□ -1.2
UBC9P50623 YLR460CYLR460C 1131 nt7.58□□□□□ -1.2
UBC9P50623 SLG1YOR008C 1137 nt7.58□□□□□ -1.2
UBC9P50623 TPO4YOR273C 1980 nt7.58□□□□□ -1.2
UBC9P50623 TRP2YER090W 1524 nt7.57□□□□□ -1.2
UBC9P50623 YJR149WYJR149W 1215 nt7.57□□□□□ -1.2
UBC9P50623 FET5YFL041W 1869 nt7.57□□□□□ -1.2
UBC9P50623 HTS1YPR033C 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
UBC9P50623 ECM27YJR106W 2178 nt7.56□□□□□ -1.2
UBC9P50623 YGR210CYGR210C 1236 nt7.56□□□□□ -1.2
UBC9P50623 YIR035CYIR035C 765 nt7.56□□□□□ -1.2
UBC9P50623 THI6YPL214C 1623 nt7.56□□□□□ -1.2
UBC9P50623 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.55□□□□□ -1.2
UBC9P50623 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.55□□□□□ -1.2
UBC9P50623 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.55□□□□□ -1.2
UBC9P50623 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.55□□□□□ -1.2
UBC9P50623 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.55□□□□□ -1.2
UBC9P50623 NPL6YMR091C 1308 nt7.54□□□□□ -1.2
UBC9P50623 EHD3YDR036C 1503 nt7.54□□□□□ -1.2
UBC9P50623 snR86snR86 1004 nt7.54□□□□□ -1.2
UBC9P50623 SAM50YNL026W 1455 nt7.54□□□□□ -1.2
UBC9P50623 CHS7YHR142W 951 nt7.53□□□□□ -1.2
UBC9P50623 BUB2YMR055C 921 nt7.53□□□□□ -1.2
UBC9P50623 UBP13YBL067C 2244 nt7.53□□□□□ -1.2
UBC9P50623 YCP4YCR004C 744 nt7.52□□□□□ -1.21
UBC9P50623 OLA1YBR025C 1185 nt7.52□□□□□ -1.21
UBC9P50623 FCY1YPR062W 477 nt7.51□□□□□ -1.21
UBC9P50623 SNU71YGR013W 1863 nt7.51□□□□□ -1.21
UBC9P50623 MET22YOL064C 1074 nt7.5□□□□□ -1.21
UBC9P50623 YPL071CYPL071C 471 nt7.5□□□□□ -1.21
UBC9P50623 HXT11YOL156W 1704 nt7.49□□□□□ -1.21
UBC9P50623 MEP1YGR121C 1479 nt7.49□□□□□ -1.21
UBC9P50623 YBR056WYBR056W 1506 nt7.49□□□□□ -1.21
UBC9P50623 YMR166CYMR166C 1107 nt7.49□□□□□ -1.21
UBC9P50623 YCR049CYCR049C 447 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 LSP1YPL004C 1026 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 YPL108WYPL108W 507 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 NPP1YCR026C 2229 nt7.48□□□□□ -1.21
UBC9P50623 SWM1YDR260C 513 nt7.47□□□□□ -1.21
UBC9P50623 OCH1YGL038C 1443 nt7.46□□□□□ -1.21
UBC9P50623 CAK1YFL029C 1107 nt7.46□□□□□ -1.22
UBC9P50623 RNA170RNA170 169 nt7.46□□□□□ -1.22
UBC9P50623 AST1YBL069W 1290 nt7.46□□□□□ -1.22
UBC9P50623 SGV1YPR161C 1974 nt7.46□□□□□ -1.22
UBC9P50623 HOS2YGL194C 1359 nt7.46□□□□□ -1.22
UBC9P50623 FRA1YLL029W 2250 nt7.45□□□□□ -1.22
UBC9P50623 YLR072WYLR072W 2082 nt7.45□□□□□ -1.22
UBC9P50623 YHR145CYHR145C 357 nt7.45□□□□□ -1.22
UBC9P50623 YOR072WYOR072W 315 nt7.45□□□□□ -1.22
UBC9P50623 PDC6YGR087C 1692 nt7.44□□□□□ -1.22
UBC9P50623 SRM1YGL097W 1449 nt7.44□□□□□ -1.22
UBC9P50623 YMR007WYMR007W 381 nt7.44□□□□□ -1.22
UBC9P50623 MIM1YOL026C 342 nt7.44□□□□□ -1.22
UBC9P50623 YMR210WYMR210W 1350 nt7.44□□□□□ -1.22
UBC9P50623 LEA1YPL213W 717 nt7.43□□□□□ -1.22
UBC9P50623 RRT14YIL127C 621 nt7.42□□□□□ -1.22
UBC9P50623 HIS3YOR202W 663 nt7.42□□□□□ -1.22
UBC9P50623 GAL2YLR081W 1725 nt7.41□□□□□ -1.22
UBC9P50623 BUR6YER159C 429 nt7.41□□□□□ -1.22
UBC9P50623 RCR1YBR005W 642 nt7.41□□□□□ -1.22
UBC9P50623 RHO1YPR165W 630 nt7.41□□□□□ -1.22
UBC9P50623 TOK1YJL093C 2076 nt7.4□□□□□ -1.22
UBC9P50623 INO1YJL153C 1602 nt7.4□□□□□ -1.22
UBC9P50623 ABP1YCR088W 1779 nt7.39□□□□□ -1.23
UBC9P50623 YPT31YER031C 672 nt7.39□□□□□ -1.23
UBC9P50623 ORM1YGR038W 669 nt7.39□□□□□ -1.23
UBC9P50623 ORT1YOR130C 879 nt7.39□□□□□ -1.23
UBC9P50623 SCO2YBR024W 906 nt7.39□□□□□ -1.23
UBC9P50623 NDE2YDL085W 1638 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 ALD5YER073W 1563 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 THI73YLR004C 1572 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 EHT1YBR177C 1356 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 SRN2YLR119W 642 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 YMR147WYMR147W 672 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 HBS1YKR084C 1836 nt7.38□□□□□ -1.23
UBC9P50623 HXK1YFR053C 1458 nt7.37□□□□□ -1.23
UBC9P50623 YJL160CYJL160C 864 nt7.37□□□□□ -1.23
UBC9P50623 YOR300WYOR300W 309 nt7.37□□□□□ -1.23
UBC9P50623 LRO1YNR008W 1986 nt7.37□□□□□ -1.23
UBC9P50623 PET18YCR020C 648 nt7.36□□□□□ -1.23
UBC9P50623 BUD31YCR063W 474 nt7.36□□□□□ -1.23
UBC9P50623 YIA6YIL006W 1122 nt7.36□□□□□ -1.23
UBC9P50623 APM1YPL259C 1428 nt7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.7 ms