Protein–RNA interactions for Protein: P48016

ATH1, Vacuolar acid trehalase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATH1P48016 PAU15YIR041W 375 nt10.12□□□□□ -0.79
ATH1P48016 RPS14BYJL191W 417 nt10.12□□□□□ -0.79
ATH1P48016 THI80YOR143C 960 nt10.12□□□□□ -0.79
ATH1P48016 YBR138CYBR138C 1575 nt10.12□□□□□ -0.79
ATH1P48016 DML1YMR211W 1428 nt10.11□□□□□ -0.79
ATH1P48016 FUN14YAL008W 597 nt10.1□□□□□ -0.79
ATH1P48016 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.1□□□□□ -0.79
ATH1P48016 ATG19YOL082W 1248 nt10.1□□□□□ -0.79
ATH1P48016 LST7YGR057C 729 nt10.09□□□□□ -0.79
ATH1P48016 AIM23YJL131C 1071 nt10.09□□□□□ -0.79
ATH1P48016 UTH1YKR042W 1098 nt10.09□□□□□ -0.79
ATH1P48016 CMK1YFR014C 1341 nt10.08□□□□□ -0.8
ATH1P48016 HVG1YER039C 750 nt10.08□□□□□ -0.8
ATH1P48016 SWE1YJL187C 2460 nt10.07□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YGR066CYGR066C 879 nt10.07□□□□□ -0.8
ATH1P48016 MTR2YKL186C 555 nt10.07□□□□□ -0.8
ATH1P48016 MRPL23YOR150W 492 nt10.07□□□□□ -0.8
ATH1P48016 RXT2YBR095C 1293 nt10.07□□□□□ -0.8
ATH1P48016 TSC10YBR265W 963 nt10.07□□□□□ -0.8
ATH1P48016 MRP1YDR347W 966 nt10.06□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YFR057WYFR057W 456 nt10.06□□□□□ -0.8
ATH1P48016 MSP1YGR028W 1089 nt10.06□□□□□ -0.8
ATH1P48016 ARO9YHR137W 1542 nt10.06□□□□□ -0.8
ATH1P48016 SLI1YGR212W 1407 nt10.06□□□□□ -0.8
ATH1P48016 BUD31YCR063W 474 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YDL119CYDL119C 924 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YDL129WYDL129W 876 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 RIB3YDR487C 627 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YGR012WYGR012W 1182 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YJL195CYJL195C 702 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 SUI2YJR007W 915 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YKR075CYKR075C 924 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 AVO2YMR068W 1281 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YMR187CYMR187C 1296 nt10.05□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YLR279WYLR279W 390 nt10.04□□□□□ -0.8
ATH1P48016 CDS1YBR029C 1374 nt10.03□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt10.03□□□□□ -0.8
ATH1P48016 YBR134WYBR134W 402 nt10.03□□□□□ -0.8
ATH1P48016 NBP2YDR162C 711 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 SNF7YLR025W 723 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 YLR366WYLR366W 306 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 YML101C-AYML101C-A 318 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 CSM3YMR048W 954 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 PBP2YBR233W 1242 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 MDM10YAL010C 1482 nt10.02□□□□□ -0.81
ATH1P48016 YLR271WYLR271W 825 nt10□□□□□ -0.81
ATH1P48016 OXA1YER154W 1209 nt9.99□□□□□ -0.81
ATH1P48016 RUF5-1RUF5-1 710 nt9.99□□□□□ -0.81
ATH1P48016 RUF5-2RUF5-2 710 nt9.99□□□□□ -0.81
ATH1P48016 YPR177CYPR177C 372 nt9.99□□□□□ -0.81
ATH1P48016 DIT1YDR403W 1611 nt9.99□□□□□ -0.81
ATH1P48016 TIR3YIL011W 810 nt9.98□□□□□ -0.81
ATH1P48016 VTA1YLR181C 993 nt9.98□□□□□ -0.81
ATH1P48016 DUT1YBR252W 444 nt9.98□□□□□ -0.81
ATH1P48016 NRT1YOR071C 1797 nt9.98□□□□□ -0.81
ATH1P48016 GEP7YGL057C 864 nt9.97□□□□□ -0.81
ATH1P48016 YKL091CYKL091C 933 nt9.97□□□□□ -0.81
ATH1P48016 TOM6YOR045W 186 nt9.97□□□□□ -0.81
ATH1P48016 ECM2YBR065C 1095 nt9.97□□□□□ -0.81
ATH1P48016 CLP1YOR250C 1338 nt9.97□□□□□ -0.81
ATH1P48016 EHD3YDR036C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
ATH1P48016 GET3YDL100C 1065 nt9.96□□□□□ -0.82
ATH1P48016 CAB5YDR196C 726 nt9.96□□□□□ -0.82
ATH1P48016 PEX2YJL210W 816 nt9.96□□□□□ -0.82
ATH1P48016 TLG2YOL018C 1194 nt9.96□□□□□ -0.82
ATH1P48016 GPN2YOR262W 1044 nt9.96□□□□□ -0.82
ATH1P48016 VBA3YCL069W 1377 nt9.96□□□□□ -0.82
ATH1P48016 ARI1YGL157W 1044 nt9.95□□□□□ -0.82
ATH1P48016 ADH4YGL256W 1149 nt9.95□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt9.95□□□□□ -0.82
ATH1P48016 SRT1YMR101C 1032 nt9.95□□□□□ -0.82
ATH1P48016 HIP1YGR191W 1812 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 PEX7YDR142C 1128 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 RTN1YDR233C 888 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 ADK2YER170W 678 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 SHH4YLR164W 507 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 LEU2YCL018W 1095 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 AGP1YCL025C 1902 nt9.94□□□□□ -0.82
ATH1P48016 NAR1YNL240C 1476 nt9.93□□□□□ -0.82
ATH1P48016 ARG7YMR062C 1326 nt9.93□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YDL114WYDL114W 927 nt9.93□□□□□ -0.82
ATH1P48016 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.93□□□□□ -0.82
ATH1P48016 ADH1YOL086C 1047 nt9.93□□□□□ -0.82
ATH1P48016 MRP13YGR084C 1020 nt9.92□□□□□ -0.82
ATH1P48016 DID2YKR035W-A 615 nt9.92□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.92□□□□□ -0.82
ATH1P48016 SMF3YLR034C 1422 nt9.91□□□□□ -0.82
ATH1P48016 MCM21YDR318W 1107 nt9.91□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YFH7YFR007W 1062 nt9.91□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YPL277CYPL277C 1464 nt9.91□□□□□ -0.82
ATH1P48016 PAF1YBR279W 1338 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YCR016WYCR016W 873 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YPI1YFR003C 468 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 NBP35YGL091C 987 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 CPD1YGR247W 720 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YHR140WYHR140W 720 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 HCR1YLR192C 798 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 YML089CYML089C 369 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 CTL1YMR180C 963 nt9.9□□□□□ -0.82
ATH1P48016 CCA1YER168C 1641 nt9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.1 ms