Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB1P53618 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB1P53618 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB1P53618 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB1P53618 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB1P53618 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB1P53618 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms