Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms