Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms