Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms