Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNIKQ9UKE5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms