Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3C1V9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms