Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNE4Q8N205 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms