Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP3Q6Q6R5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms