Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SEC24CP53992 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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