Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHKA1P46020 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms