Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNIKQ9UKE5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNIKQ9UKE5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.39■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms