Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms