Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHMG1C9JSJ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms