Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms