Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.16□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 TMA7YLR262C-A 195 nt2.16□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 SKI3YPR189W 4299 nt2.16□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 CFT1YDR301W 4074 nt2.15□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.15□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 CDC25YLR310C 4770 nt2.13□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 MON2YNL297C 4911 nt2.13□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 PMD1YER132C 5262 nt2.12□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 TRM732YMR259C 4263 nt2.11□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 BRR2YER172C 6492 nt2.1□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 CCH1YGR217W 6120 nt2.09□□□□□ -2.07
MSB4Q12317 SWI4YER111C 3282 nt2.09□□□□□ -2.08
MSB4Q12317 snR67snR67 82 nt2.08□□□□□ -2.08
MSB4Q12317 DNF3YMR162C 4971 nt2.07□□□□□ -2.08
MSB4Q12317 YMR160WYMR160W 2451 nt2.06□□□□□ -2.08
MSB4Q12317 CLU1YMR012W 3834 nt2.05□□□□□ -2.08
MSB4Q12317 LAA1YJL207C 6045 nt2.02□□□□□ -2.09
MSB4Q12317 SSK2YNR031C 4740 nt2.02□□□□□ -2.09
MSB4Q12317 NUP188YML103C 4968 nt2.01□□□□□ -2.09
MSB4Q12317 NUP145YGL092W 3954 nt2.01□□□□□ -2.09
MSB4Q12317 YGR130CYGR130C 2451 nt1.99□□□□□ -2.09
MSB4Q12317 CDC39YCR093W 6327 nt1.97□□□□□ -2.09
MSB4Q12317 FIG2YCR089W 4830 nt1.94□□□□□ -2.1
MSB4Q12317 MEC1YBR136W 7107 nt1.89□□□□□ -2.11
MSB4Q12317 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.87□□□□□ -2.11
MSB4Q12317 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.84□□□□□ -2.11
MSB4Q12317 PAU24YBR301W 363 nt1.84□□□□□ -2.11
MSB4Q12317 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.83□□□□□ -2.12
MSB4Q12317 VAM6YDL077C 3150 nt1.82□□□□□ -2.12
MSB4Q12317 snR77snR77 88 nt1.81□□□□□ -2.12
MSB4Q12317 IML1YJR138W 4755 nt1.81□□□□□ -2.12
MSB4Q12317 VPS15YBR097W 4365 nt1.78□□□□□ -2.12
MSB4Q12317 BST1YFL025C 3090 nt1.77□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.74□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 YPR117WYPR117W 7470 nt1.73□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 SPT7YBR081C 3999 nt1.73□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 SOV1YMR066W 2697 nt1.72□□□□□ -2.13
MSB4Q12317 BUD3YCL014W 4911 nt1.71□□□□□ -2.14
MSB4Q12317 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.71□□□□□ -2.14
MSB4Q12317 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.69□□□□□ -2.14
MSB4Q12317 MLP2YIL149C 5040 nt1.68□□□□□ -2.14
MSB4Q12317 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.63□□□□□ -2.15
MSB4Q12317 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.63□□□□□ -2.15
MSB4Q12317 IRA1YBR140C 9279 nt1.61□□□□□ -2.15
MSB4Q12317 RKR1YMR247C 4689 nt1.58□□□□□ -2.16
MSB4Q12317 SBH2YER019C-A 267 nt1.58□□□□□ -2.16
MSB4Q12317 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.48□□□□□ -2.17
MSB4Q12317 HKR1YDR420W 5409 nt1.46□□□□□ -2.18
MSB4Q12317 LTE1YAL024C 4308 nt1.44□□□□□ -2.18
MSB4Q12317 UTP20YBL004W 7482 nt1.4□□□□□ -2.18
MSB4Q12317 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.4□□□□□ -2.19
MSB4Q12317 THO2YNL139C 4794 nt1.39□□□□□ -2.19
MSB4Q12317 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.35□□□□□ -2.19
MSB4Q12317 YOL014WYOL014W 375 nt1.28□□□□□ -2.2
MSB4Q12317 BEM2YER155C 6504 nt1.26□□□□□ -2.21
MSB4Q12317 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt1.26□□□□□ -2.21
MSB4Q12317 DOP1YDR141C 5097 nt1.24□□□□□ -2.21
MSB4Q12317 SCC2YDR180W 4482 nt1.21□□□□□ -2.22
MSB4Q12317 YJR029WYJR029W 5268 nt1.19□□□□□ -2.22
MSB4Q12317 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.19□□□□□ -2.22
MSB4Q12317 ESP1YGR098C 4893 nt1.16□□□□□ -2.22
MSB4Q12317 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.1□□□□□ -2.23
MSB4Q12317 RPL41BYDL133C-A 78 nt1.09□□□□□ -2.23
MSB4Q12317 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.06□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.06□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt1.06□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.04□□□□□ -2.24
MSB4Q12317 PAU9YBL108C-A 129 nt1.02□□□□□ -2.25
MSB4Q12317 MLP1YKR095W 5628 nt1□□□□□ -2.25
MSB4Q12317 IQG1YPL242C 4488 nt0.98□□□□□ -2.25
MSB4Q12317 snR6snR6 112 nt0.98□□□□□ -2.25
MSB4Q12317 FMP27YLR454W 7887 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
MSB4Q12317 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.6 ms