Protein–RNA interactions for Protein: Q12240

YDR215C, Uncharacterized protein YDR215C, yeastyeast

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR215CQ12240 NUP188YML103C 4968 nt1.51□□□□□ -2.17
YDR215CQ12240 TRM732YMR259C 4263 nt1.5□□□□□ -2.17
YDR215CQ12240 BRR2YER172C 6492 nt1.49□□□□□ -2.17
YDR215CQ12240 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.49□□□□□ -2.17
YDR215CQ12240 MEC1YBR136W 7107 nt1.47□□□□□ -2.17
YDR215CQ12240 NUP192YJL039C 5052 nt1.46□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 PEP1YBL017C 4740 nt1.44□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.44□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 CDC39YCR093W 6327 nt1.42□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 IRA1YBR140C 9279 nt1.41□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 SSK2YNR031C 4740 nt1.41□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 LAA1YJL207C 6045 nt1.41□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 BST1YFL025C 3090 nt1.41□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 CFT1YDR301W 4074 nt1.4□□□□□ -2.18
YDR215CQ12240 VPS15YBR097W 4365 nt1.4□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 MYO1YHR023W 5787 nt1.4□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 CAT8YMR280C 4302 nt1.4□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.38□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.37□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.37□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.36□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 CLU1YMR012W 3834 nt1.34□□□□□ -2.19
YDR215CQ12240 snR67snR67 82 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR215CQ12240 YGR130CYGR130C 2451 nt1.32□□□□□ -2.2
YDR215CQ12240 HKR1YDR420W 5409 nt1.31□□□□□ -2.2
YDR215CQ12240 SPT7YBR081C 3999 nt1.29□□□□□ -2.2
YDR215CQ12240 BUD3YCL014W 4911 nt1.28□□□□□ -2.2
YDR215CQ12240 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.27□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.27□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 SPC110YDR356W 2835 nt1.25□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 PAU24YBR301W 363 nt1.25□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 snR40snR40 97 nt1.23□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.23□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 CCH1YGR217W 6120 nt1.22□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YDR215CQ12240 YMR160WYMR160W 2451 nt1.2□□□□□ -2.22
YDR215CQ12240 VAM6YDL077C 3150 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR215CQ12240 DOP1YDR141C 5097 nt1.19□□□□□ -2.22
YDR215CQ12240 RKR1YMR247C 4689 nt1.15□□□□□ -2.23
YDR215CQ12240 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.08□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.08□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 YPR117WYPR117W 7470 nt1.08□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 MLP2YIL149C 5040 nt1.06□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 IML1YJR138W 4755 nt1.05□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 LTE1YAL024C 4308 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR215CQ12240 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR215CQ12240 snR77snR77 88 nt0.96□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 SCC2YDR180W 4482 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 YOL014WYOL014W 375 nt0.91□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 UTP20YBL004W 7482 nt0.91□□□□□ -2.26
YDR215CQ12240 SBH2YER019C-A 267 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR215CQ12240 THO2YNL139C 4794 nt0.84□□□□□ -2.28
YDR215CQ12240 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR215CQ12240 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.77□□□□□ -2.29
YDR215CQ12240 MLP1YKR095W 5628 nt0.77□□□□□ -2.29
YDR215CQ12240 SOV1YMR066W 2697 nt0.76□□□□□ -2.29
YDR215CQ12240 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR215CQ12240 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR215CQ12240 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR215CQ12240 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR215CQ12240 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR215CQ12240 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR215CQ12240 PAU9YBL108C-A 129 nt0.64□□□□□ -2.31
YDR215CQ12240 IQG1YPL242C 4488 nt0.64□□□□□ -2.31
YDR215CQ12240 ESP1YGR098C 4893 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR215CQ12240 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.6□□□□□ -2.31
YDR215CQ12240 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
YDR215CQ12240 snR128snR128 126 nt0.53□□□□□ -2.32
YDR215CQ12240 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR215CQ12240 FMP27YLR454W 7887 nt0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.3 ms