Protein–RNA interactions for Protein: Q06616

YPR174C, Nuclear envelope protein YPR174C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR174CQ06616 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.78□□□□□ -2.53
YPR174CQ06616 YER181CYER181C 324 nt-0.81□□□□□ -2.54
YPR174CQ06616 YFL019CYFL019C 354 nt-0.81□□□□□ -2.54
YPR174CQ06616 GIM4YEL003W 336 nt-0.83□□□□□ -2.54
YPR174CQ06616 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.83□□□□□ -2.54
YPR174CQ06616 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.83□□□□□ -2.54
YPR174CQ06616 YNL266WYNL266W 420 nt-0.84□□□□□ -2.54
YPR174CQ06616 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.85□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 snR49snR49 165 nt-0.85□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.86□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.86□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 snR50snR50 90 nt-0.86□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.88□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 RDS3YPR094W 324 nt-0.88□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 snR55snR55 98 nt-0.89□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 snR39BsnR39B 96 nt-0.89□□□□□ -2.55
YPR174CQ06616 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.92□□□□□ -2.56
YPR174CQ06616 JLP2YMR132C 627 nt-0.94□□□□□ -2.56
YPR174CQ06616 snR161snR161 161 nt-0.94□□□□□ -2.56
YPR174CQ06616 YOR302WYOR302W 78 nt-0.99□□□□□ -2.57
YPR174CQ06616 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1□□□□□ -2.57
YPR174CQ06616 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.01□□□□□ -2.57
YPR174CQ06616 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.01□□□□□ -2.57
YPR174CQ06616 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.01□□□□□ -2.57
YPR174CQ06616 snR65snR65 100 nt-1.03□□□□□ -2.57
YPR174CQ06616 snR67snR67 82 nt-1.04□□□□□ -2.58
YPR174CQ06616 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.05□□□□□ -2.58
YPR174CQ06616 SKI7YOR076C 2244 nt-1.06□□□□□ -2.58
YPR174CQ06616 YBR178WYBR178W 375 nt-1.07□□□□□ -2.58
YPR174CQ06616 snR48snR48 113 nt-1.07□□□□□ -2.58
YPR174CQ06616 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1.1□□□□□ -2.59
YPR174CQ06616 YNL205CYNL205C 423 nt-1.1□□□□□ -2.59
YPR174CQ06616 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.11□□□□□ -2.59
YPR174CQ06616 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.12□□□□□ -2.59
YPR174CQ06616 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.15□□□□□ -2.59
YPR174CQ06616 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.17□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.17□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 snR52snR52 92 nt-1.17□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 snR56snR56 88 nt-1.2□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 YOR102WYOR102W 351 nt-1.21□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.22□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.22□□□□□ -2.6
YPR174CQ06616 snR80snR80 171 nt-1.23□□□□□ -2.61
YPR174CQ06616 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.26□□□□□ -2.61
YPR174CQ06616 YNR077CYNR077C 255 nt-1.26□□□□□ -2.61
YPR174CQ06616 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.27□□□□□ -2.61
YPR174CQ06616 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.28□□□□□ -2.61
YPR174CQ06616 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.32□□□□□ -2.62
YPR174CQ06616 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.37□□□□□ -2.63
YPR174CQ06616 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.37□□□□□ -2.63
YPR174CQ06616 snR77snR77 88 nt-1.4□□□□□ -2.63
YPR174CQ06616 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.42□□□□□ -2.64
YPR174CQ06616 YNL198CYNL198C 303 nt-1.42□□□□□ -2.64
YPR174CQ06616 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.43□□□□□ -2.64
YPR174CQ06616 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.46□□□□□ -2.64
YPR174CQ06616 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.49□□□□□ -2.65
YPR174CQ06616 YBL053WYBL053W 375 nt-1.49□□□□□ -2.65
YPR174CQ06616 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.52□□□□□ -2.65
YPR174CQ06616 YJL150WYJL150W 303 nt-1.52□□□□□ -2.65
YPR174CQ06616 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.55□□□□□ -2.66
YPR174CQ06616 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.57□□□□□ -2.66
YPR174CQ06616 snR81snR81 201 nt-1.6□□□□□ -2.67
YPR174CQ06616 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.65□□□□□ -2.67
YPR174CQ06616 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.65□□□□□ -2.67
YPR174CQ06616 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.68□□□□□ -2.68
YPR174CQ06616 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.72□□□□□ -2.68
YPR174CQ06616 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.76□□□□□ -2.69
YPR174CQ06616 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.77□□□□□ -2.69
YPR174CQ06616 RPL41AYDL184C 78 nt-1.78□□□□□ -2.69
YPR174CQ06616 YGR151CYGR151C 336 nt-1.81□□□□□ -2.7
YPR174CQ06616 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.81□□□□□ -2.7
YPR174CQ06616 snR38snR38 95 nt-1.81□□□□□ -2.7
YPR174CQ06616 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.82□□□□□ -2.7
YPR174CQ06616 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.82□□□□□ -2.7
YPR174CQ06616 SPG3YDR504C 384 nt-1.83□□□□□ -2.7
YPR174CQ06616 YOR309CYOR309C 381 nt-1.87□□□□□ -2.71
YPR174CQ06616 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.9□□□□□ -2.71
YPR174CQ06616 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.94□□□□□ -2.72
YPR174CQ06616 Q0142Q0142 177 nt-1.96□□□□□ -2.72
YPR174CQ06616 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.97□□□□□ -2.72
YPR174CQ06616 snR47snR47 99 nt-2□□□□□ -2.73
YPR174CQ06616 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-2.02□□□□□ -2.73
YPR174CQ06616 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-2.02□□□□□ -2.73
YPR174CQ06616 snR6snR6 112 nt-2.05□□□□□ -2.74
YPR174CQ06616 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.1□□□□□ -2.75
YPR174CQ06616 YNL338WYNL338W 159 nt-2.12□□□□□ -2.75
YPR174CQ06616 YNL337WYNL337W 255 nt-2.18□□□□□ -2.76
YPR174CQ06616 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.18□□□□□ -2.76
YPR174CQ06616 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.21□□□□□ -2.76
YPR174CQ06616 YKL225WYKL225W 348 nt-2.21□□□□□ -2.76
YPR174CQ06616 snR73snR73 106 nt-2.23□□□□□ -2.77
YPR174CQ06616 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.29□□□□□ -2.78
YPR174CQ06616 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.31□□□□□ -2.78
YPR174CQ06616 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.32□□□□□ -2.78
YPR174CQ06616 YDR543CYDR543C 300 nt-2.35□□□□□ -2.79
YPR174CQ06616 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.42□□□□□ -2.8
YPR174CQ06616 snR85snR85 171 nt-2.46□□□□□ -2.8
YPR174CQ06616 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.48□□□□□ -2.81
YPR174CQ06616 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.49□□□□□ -2.81
YPR174CQ06616 Q0032Q0032 291 nt-2.51□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.7 ms