Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.67□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 YJL182CYJL182C 318 nt-0.68□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 snR49snR49 165 nt-0.7□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 YOR170WYOR170W 306 nt-0.71□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 snR69snR69 101 nt-0.72□□□□□ -2.52
TRM12Q04235 snR39BsnR39B 96 nt-0.73□□□□□ -2.53
TRM12Q04235 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.74□□□□□ -2.53
TRM12Q04235 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.75□□□□□ -2.53
TRM12Q04235 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.76□□□□□ -2.53
TRM12Q04235 RDS3YPR094W 324 nt-0.78□□□□□ -2.53
TRM12Q04235 snR65snR65 100 nt-0.79□□□□□ -2.54
TRM12Q04235 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.79□□□□□ -2.54
TRM12Q04235 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRM12Q04235 snR56snR56 88 nt-0.83□□□□□ -2.54
TRM12Q04235 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.83□□□□□ -2.54
TRM12Q04235 snR50snR50 90 nt-0.84□□□□□ -2.54
TRM12Q04235 snR161snR161 161 nt-0.85□□□□□ -2.55
TRM12Q04235 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.86□□□□□ -2.55
TRM12Q04235 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.86□□□□□ -2.55
TRM12Q04235 YNL266WYNL266W 420 nt-0.86□□□□□ -2.55
TRM12Q04235 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.86□□□□□ -2.55
TRM12Q04235 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
TRM12Q04235 YOR302WYOR302W 78 nt-0.91□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.92□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.92□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 JLP2YMR132C 627 nt-0.92□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.95□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.96□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 YNL205CYNL205C 423 nt-0.96□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 snR52snR52 92 nt-0.96□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 snR67snR67 82 nt-0.97□□□□□ -2.56
TRM12Q04235 snR48snR48 113 nt-0.98□□□□□ -2.57
TRM12Q04235 YBR178WYBR178W 375 nt-0.99□□□□□ -2.57
TRM12Q04235 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.99□□□□□ -2.57
TRM12Q04235 YOR102WYOR102W 351 nt-1□□□□□ -2.57
TRM12Q04235 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.02□□□□□ -2.57
TRM12Q04235 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.03□□□□□ -2.57
TRM12Q04235 SKI7YOR076C 2244 nt-1.04□□□□□ -2.58
TRM12Q04235 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.05□□□□□ -2.58
TRM12Q04235 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.07□□□□□ -2.58
TRM12Q04235 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.09□□□□□ -2.58
TRM12Q04235 YNR077CYNR077C 255 nt-1.11□□□□□ -2.59
TRM12Q04235 snR80snR80 171 nt-1.13□□□□□ -2.59
TRM12Q04235 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.17□□□□□ -2.6
TRM12Q04235 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.19□□□□□ -2.6
TRM12Q04235 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.2□□□□□ -2.6
TRM12Q04235 snR77snR77 88 nt-1.21□□□□□ -2.6
TRM12Q04235 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.22□□□□□ -2.6
TRM12Q04235 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.23□□□□□ -2.61
TRM12Q04235 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.24□□□□□ -2.61
TRM12Q04235 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.32□□□□□ -2.62
TRM12Q04235 YNL198CYNL198C 303 nt-1.32□□□□□ -2.62
TRM12Q04235 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.33□□□□□ -2.62
TRM12Q04235 snR81snR81 201 nt-1.36□□□□□ -2.63
TRM12Q04235 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.39□□□□□ -2.63
TRM12Q04235 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.39□□□□□ -2.63
TRM12Q04235 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.4□□□□□ -2.63
TRM12Q04235 YJL150WYJL150W 303 nt-1.44□□□□□ -2.64
TRM12Q04235 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.46□□□□□ -2.64
TRM12Q04235 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.49□□□□□ -2.65
TRM12Q04235 YBL053WYBL053W 375 nt-1.49□□□□□ -2.65
TRM12Q04235 YOR309CYOR309C 381 nt-1.54□□□□□ -2.66
TRM12Q04235 Q0142Q0142 177 nt-1.62□□□□□ -2.67
TRM12Q04235 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.62□□□□□ -2.67
TRM12Q04235 SPG3YDR504C 384 nt-1.64□□□□□ -2.67
TRM12Q04235 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.64□□□□□ -2.67
TRM12Q04235 RPL41AYDL184C 78 nt-1.69□□□□□ -2.68
TRM12Q04235 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.69□□□□□ -2.68
TRM12Q04235 YGR151CYGR151C 336 nt-1.71□□□□□ -2.68
TRM12Q04235 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.72□□□□□ -2.68
TRM12Q04235 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.74□□□□□ -2.69
TRM12Q04235 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.74□□□□□ -2.69
TRM12Q04235 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.78□□□□□ -2.69
TRM12Q04235 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.82□□□□□ -2.7
TRM12Q04235 snR38snR38 95 nt-1.82□□□□□ -2.7
TRM12Q04235 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.83□□□□□ -2.7
TRM12Q04235 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.84□□□□□ -2.7
TRM12Q04235 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.84□□□□□ -2.7
TRM12Q04235 snR6snR6 112 nt-1.85□□□□□ -2.71
TRM12Q04235 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.89□□□□□ -2.71
TRM12Q04235 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.9□□□□□ -2.71
TRM12Q04235 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.91□□□□□ -2.72
TRM12Q04235 YNL338WYNL338W 159 nt-1.93□□□□□ -2.72
TRM12Q04235 snR47snR47 99 nt-1.93□□□□□ -2.72
TRM12Q04235 snR73snR73 106 nt-1.96□□□□□ -2.72
TRM12Q04235 YNL337WYNL337W 255 nt-2.07□□□□□ -2.74
TRM12Q04235 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.11□□□□□ -2.75
TRM12Q04235 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.19□□□□□ -2.76
TRM12Q04235 YKL225WYKL225W 348 nt-2.19□□□□□ -2.76
TRM12Q04235 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.22□□□□□ -2.76
TRM12Q04235 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.23□□□□□ -2.77
TRM12Q04235 YDR543CYDR543C 300 nt-2.24□□□□□ -2.77
TRM12Q04235 Q0032Q0032 291 nt-2.27□□□□□ -2.77
TRM12Q04235 snR85snR85 171 nt-2.32□□□□□ -2.78
TRM12Q04235 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.32□□□□□ -2.78
TRM12Q04235 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.34□□□□□ -2.78
TRM12Q04235 snR61snR61 90 nt-2.4□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56 ms